Кишечник є центральними органом травної системи. Залози у слизовій оболонці кишечнику та інших травних залозах переробляють близько 8 літрів рідини в день. В товстий кишечник поступово всмоктується вся рідина, а більш твердій не перемеленої їжею справляються мікроорганізми, ферментуючи і синтезуючи вітамін К і фолієву кислоту.
Гостре запалення тонкої кишки може бути викликана різними чинниками, наприклад, заболеванем шлунка, жовчних протоків і жовчного міхура, підшлункової залози, цукровий діабет, серцева недостатність, недоїдання, холод, перегрівання, зміна клімату. Основна причина запального процесу в кишечнику токсична їжа, ліки, різні бактерії, віруси і грибки. Симптоми: тяжкість, здуття живота, блювання, діарея. Інший тип запального захворювання кишечника є гастроентерит. Це гостре запальне захворювання шлунка і тонкого кишечнику, яке відбувається при позивах блювоти і втрати апетиту. Цей стан триває 1-2 днів і зникає без наслідків. Причинами можуть бути споживання смаженої або вареної їжі, споживання великої кількості алкоголю, куріння, алергія на деякі лікарські препарати, споживання хімічних речовин стрес, віруси і багато іншого. Гостре запалення товстої кишки є відносно поширеним у дітей і у дорослих. Це обумовлено різними інфекційними бактеріями ( Salmonella, Shigella), найпростіші (амеби). Гострий коліт нерідко супроводжується гострим ентеритом (колиэнтерит).